Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mbd1Q9Z2E2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms