Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cpne6Q9Z140 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.4 ms