Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z139

Ror1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ror1Q9Z139 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ror1Q9Z139 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ror1Q9Z139 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms