Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccl8Q9Z121 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Ccl8Q9Z121 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Ccl8Q9Z121 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccl8Q9Z121 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ccl8Q9Z121 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ccl8Q9Z121 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ccl8Q9Z121 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl8Q9Z121 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Ccl8Q9Z121 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ccl8Q9Z121 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl8Q9Z121 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl8Q9Z121 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl8Q9Z121 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl8Q9Z121 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ccl8Q9Z121 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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Ccl8Q9Z121 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl8Q9Z121 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl8Q9Z121 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl8Q9Z121 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl8Q9Z121 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl8Q9Z121 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl8Q9Z121 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl8Q9Z121 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms