Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hmg20bQ9Z104 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmg20bQ9Z104 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmg20bQ9Z104 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmg20bQ9Z104 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmg20bQ9Z104 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmg20bQ9Z104 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmg20bQ9Z104 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmg20bQ9Z104 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmg20bQ9Z104 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmg20bQ9Z104 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmg20bQ9Z104 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmg20bQ9Z104 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmg20bQ9Z104 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hmg20bQ9Z104 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hmg20bQ9Z104 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hmg20bQ9Z104 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms