Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU3

Scn8a, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn8aQ9WTU3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn8aQ9WTU3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms