Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trpv2Q9WTR1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trpv2Q9WTR1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms