Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PplQ9R269 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PplQ9R269 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PplQ9R269 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PplQ9R269 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PplQ9R269 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PplQ9R269 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PplQ9R269 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PplQ9R269 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PplQ9R269 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PplQ9R269 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PplQ9R269 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PplQ9R269 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PplQ9R269 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PplQ9R269 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PplQ9R269 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PplQ9R269 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
PplQ9R269 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PplQ9R269 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PplQ9R269 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PplQ9R269 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PplQ9R269 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PplQ9R269 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PplQ9R269 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PplQ9R269 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PplQ9R269 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PplQ9R269 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PplQ9R269 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PplQ9R269 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms