Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S8

Capn7, Calpain-7, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn7Q9R1S8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Capn7Q9R1S8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms