Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AmfrQ9R049 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms