Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp21Q9QZL6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms