Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Rdh11Q9QYF1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Rdh11Q9QYF1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Rdh11Q9QYF1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rdh11Q9QYF1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rdh11Q9QYF1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rdh11Q9QYF1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms