Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nphp1Q9QY53 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nphp1Q9QY53 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nphp1Q9QY53 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nphp1Q9QY53 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nphp1Q9QY53 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nphp1Q9QY53 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nphp1Q9QY53 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nphp1Q9QY53 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Nphp1Q9QY53 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nphp1Q9QY53 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nphp1Q9QY53 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nphp1Q9QY53 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nphp1Q9QY53 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nphp1Q9QY53 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nphp1Q9QY53 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nphp1Q9QY53 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nphp1Q9QY53 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nphp1Q9QY53 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nphp1Q9QY53 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nphp1Q9QY53 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nphp1Q9QY53 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms