Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trpc5Q9QX29 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trpc5Q9QX29 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trpc5Q9QX29 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trpc5Q9QX29 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trpc5Q9QX29 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trpc5Q9QX29 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Trpc5Q9QX29 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trpc5Q9QX29 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trpc5Q9QX29 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trpc5Q9QX29 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trpc5Q9QX29 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trpc5Q9QX29 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trpc5Q9QX29 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trpc5Q9QX29 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trpc5Q9QX29 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trpc5Q9QX29 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trpc5Q9QX29 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trpc5Q9QX29 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trpc5Q9QX29 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trpc5Q9QX29 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trpc5Q9QX29 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms