Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkl2Q9QUK0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms