Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Trappc2lQ9JME7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms