Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CtsmQ9JL96 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CtsmQ9JL96 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms