Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nectin1Q9JKF6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms