Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Scamp5Q9JKD3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scamp5Q9JKD3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms