Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Uchl3Q9JKB1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Uchl3Q9JKB1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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Uchl3Q9JKB1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Uchl3Q9JKB1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Uchl3Q9JKB1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Uchl3Q9JKB1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Uchl3Q9JKB1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Uchl3Q9JKB1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms