Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ9

Cngb3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb3Q9JJZ9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cngb3Q9JJZ9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cngb3Q9JJZ9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms