Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Smad9Q9JIW5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms