Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ5

Htr3b, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3bQ9JHJ5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htr3bQ9JHJ5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms