Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
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Rb1cc1Q9ESK9 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rb1cc1Q9ESK9 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
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Rb1cc1Q9ESK9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
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Rb1cc1Q9ESK9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
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Rb1cc1Q9ESK9 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
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Rb1cc1Q9ESK9 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
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