Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Usp29Q9ES63 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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Usp29Q9ES63 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp29Q9ES63 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp29Q9ES63 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp29Q9ES63 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp29Q9ES63 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp29Q9ES63 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp29Q9ES63 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp29Q9ES63 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Usp29Q9ES63 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Usp29Q9ES63 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Usp29Q9ES63 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Usp29Q9ES63 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Usp29Q9ES63 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Usp29Q9ES63 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Usp29Q9ES63 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Usp29Q9ES63 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms