Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE8

Tlnrd1, Talin rod domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlnrd1Q9ERE8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tlnrd1Q9ERE8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tlnrd1Q9ERE8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tlnrd1Q9ERE8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tlnrd1Q9ERE8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tlnrd1Q9ERE8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tlnrd1Q9ERE8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tlnrd1Q9ERE8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tlnrd1Q9ERE8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tlnrd1Q9ERE8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms