Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ41

Vmn1r29, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r29Q9EQ41 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vmn1r29Q9EQ41 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r29Q9EQ41 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vmn1r29Q9EQ41 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r29Q9EQ41 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms