Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU5

Tnfrsf21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfrsf21Q9EPU5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Tnfrsf21Q9EPU5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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