Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clstn1Q9EPL2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clstn1Q9EPL2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms