Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trmt112Q9DCG9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trmt112Q9DCG9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms