Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Xab2Q9DCD2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms