Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf6Q9DBU5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf6Q9DBU5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms