Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tm9sf1Q9DBU0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tm9sf1Q9DBU0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms