Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB20

Atp5o, ATP synthase subunit O, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5oQ9DB20 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atp5oQ9DB20 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atp5oQ9DB20 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms