Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9B0

Ccdc70, Coiled-coil domain-containing protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc70Q9D9B0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc70Q9D9B0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms