Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atg7Q9D906 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg7Q9D906 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms