Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc52a2Q9D8F3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc52a2Q9D8F3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc52a2Q9D8F3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc52a2Q9D8F3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc52a2Q9D8F3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc52a2Q9D8F3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc52a2Q9D8F3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc52a2Q9D8F3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc52a2Q9D8F3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc52a2Q9D8F3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc52a2Q9D8F3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc52a2Q9D8F3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc52a2Q9D8F3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc52a2Q9D8F3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc52a2Q9D8F3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc52a2Q9D8F3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc52a2Q9D8F3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc52a2Q9D8F3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc52a2Q9D8F3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc52a2Q9D8F3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc52a2Q9D8F3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc52a2Q9D8F3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc52a2Q9D8F3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc52a2Q9D8F3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc52a2Q9D8F3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms