Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fip1l1Q9D824 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms