Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capns2Q9D7J7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capns2Q9D7J7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms