Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Chmp4cQ9D7F7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp4cQ9D7F7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp4cQ9D7F7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp4cQ9D7F7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp4cQ9D7F7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp4cQ9D7F7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp4cQ9D7F7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp4cQ9D7F7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp4cQ9D7F7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp4cQ9D7F7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp4cQ9D7F7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp4cQ9D7F7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp4cQ9D7F7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp4cQ9D7F7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp4cQ9D7F7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp4cQ9D7F7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp4cQ9D7F7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp4cQ9D7F7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp4cQ9D7F7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp4cQ9D7F7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp4cQ9D7F7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Chmp4cQ9D7F7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chmp4cQ9D7F7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chmp4cQ9D7F7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chmp4cQ9D7F7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chmp4cQ9D7F7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chmp4cQ9D7F7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Chmp4cQ9D7F7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms