Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Klhl40Q9D783 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klhl40Q9D783 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms