Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gbe1Q9D6Y9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gbe1Q9D6Y9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms