Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc3Q9D6Y1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms