Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm5Q9D6G9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm5Q9D6G9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm5Q9D6G9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm5Q9D6G9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm5Q9D6G9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm5Q9D6G9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm5Q9D6G9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm5Q9D6G9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm5Q9D6G9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm5Q9D6G9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm5Q9D6G9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm5Q9D6G9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm5Q9D6G9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm5Q9D6G9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm5Q9D6G9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm5Q9D6G9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm5Q9D6G9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm5Q9D6G9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm5Q9D6G9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm5Q9D6G9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cmtm5Q9D6G9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cmtm5Q9D6G9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Cmtm5Q9D6G9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cmtm5Q9D6G9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cmtm5Q9D6G9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cmtm5Q9D6G9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms