Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc81Q9D5W4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc81Q9D5W4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms