Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syce1Q9D495 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Syce1Q9D495 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms