Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt20Q9D312 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms