Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2A5

Creb3l4, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l4Q9D2A5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Creb3l4Q9D2A5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Creb3l4Q9D2A5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Creb3l4Q9D2A5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Creb3l4Q9D2A5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Creb3l4Q9D2A5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Creb3l4Q9D2A5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Creb3l4Q9D2A5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Creb3l4Q9D2A5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Creb3l4Q9D2A5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Creb3l4Q9D2A5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Creb3l4Q9D2A5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Creb3l4Q9D2A5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Creb3l4Q9D2A5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Creb3l4Q9D2A5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Creb3l4Q9D2A5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Creb3l4Q9D2A5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Creb3l4Q9D2A5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Creb3l4Q9D2A5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Creb3l4Q9D2A5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Creb3l4Q9D2A5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Creb3l4Q9D2A5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Creb3l4Q9D2A5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Creb3l4Q9D2A5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Creb3l4Q9D2A5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Creb3l4Q9D2A5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Creb3l4Q9D2A5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Creb3l4Q9D2A5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Creb3l4Q9D2A5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Creb3l4Q9D2A5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Creb3l4Q9D2A5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3l4Q9D2A5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms