Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Susd3Q9D176 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Susd3Q9D176 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms