Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hddc3Q9D114 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hddc3Q9D114 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms